继高端公司之后，台湾另一家自产疫苗厂联亚生技也陷入“炒股疑云”。先是岛内传出巴拉圭向与联亚生技有合作关系的美国药厂订购疫苗，台“外交部”迅速为此背书，让民众以为巴拉圭即将采购联亚疫苗。没想到联亚药厂23日登录兴柜（岛内规定，公司在申请上市、上柜前必须登录兴柜市场满6个月）首日股价大涨6倍多后，又发布消息澄清称，并未接到巴拉圭采购订单。

联亚生技是由美国联合生物医学（UBI）与台湾当局1998年共同成立的，创办人为王长怡，美国颇具争议的黑水公司创办人普林斯也是股东之一。联亚药厂2014年从联亚生技独立，在UBI集团海内外新冠疫苗开发布局中，它主要承担下游充填分装任务，目前拥有一条年产1000万瓶的无菌针剂生产线，宣称新冠疫苗年产可达1亿剂。据台湾“中央社”报道，与联亚生技密切合作研发新一代疫苗的美国公司Vaxxinity宣布，巴拉圭政府购买100万剂疫苗。台“外交部”22日“证实”，联亚疫苗一旦取得台湾“食药署”紧急授权，巴拉圭就可率先成为获得此疫苗的地区之一。

《经济日报》24日称，联亚药厂曾在2015年登录兴柜，当时股价表现不如预期，后在2019年10月18日宣布终止兴柜交易，并调整经营策略、改善财务结构，23日重新以每股30元（新台币，下同）登录兴柜。结果股价盘中冲破220元，收盘215元，一天内涨幅高达633%。收市后，联亚药厂才发布消息称，巴拉圭签约对象为同属UBI集团的美国Vaxxinity公司；该公司拿下订单后，可以委托联亚生技提供疫苗，也可以向其他国际疫苗品牌下单，“目前可以确定的是，联亚没收到委托订单”。集团仍在等待6月底前将二期临床分析结果送审，目标是7月中旬通过紧急授权，之后才会真正接海内外订单。

岛内舆论质疑这是“自导自演、疑似炒股”。有生技业者表示，高端疫苗日前传出拿到菲律宾订单，股价马上冲到涨停板，最后证实乌龙一场，股价应声而跌，“类似的剧情竟在联亚药厂挂牌之际上演，哪有这么巧合的事？”“中广”董事长赵少康质问道，联亚22日为何不出面澄清没接到订单？资深媒体人尹乃菁质疑民进党当局带头炒作股价。前台北市副市长李永萍也呼吁调查部门不要再等检举，立刻介入调查。在巴拉圭国内，民众对于购买台湾疫苗也强烈反对。有舆论直言，巴拉圭人民不想成为试验者的小白鼠。